然而，木村政昭認為這些建筑結構大約建造于6000年前，當時這個古老的城市還處于海平面之上。最近，木村政昭又宣稱這些建筑結構可能建造于3000到2000年前，因為當時的海平面已接近20世紀的水平。后來，由于地質運動，導致這片土地沉沒于海水之下。

　　對于木村政昭的猜測，其他考古學家進行了反駁。加拿大英屬哥倫比亞大學東亞考古專家理查德-皮爾森認為，與那國島出土的文物表明那里的人類文明可以追溯到公元前2000到2500年。當時，那里的人類群體非常小，不可能擁有如此非凡的能力建造這些巨大的石材結構。而且臺灣距離與那國島很近，雖然臺灣人民那時已經(jīng)開始用石頭建造房屋，但在臺灣也沒有發(fā)現(xiàn)任何與與那國島相似的證據(jù)。

　　不管專家們如何辯論，但這些巨大的神奇結構確實存在。在今天，即使不用專業(yè)的潛水設備，人們都可以很容易看到這些鬼斧神工般的巖層。無論是天然之城也好，還是沉沒的遠古文明也好，這片水下奇跡留下的眾多謎團吸引了世界各地大批游客和考古愛好者的獵奇。